这是一部历史剧,讲述的是顺治时期,前明长平公主(独臂神尼)为实现反清复明的理想,利用朝廷寻找忠臣遗孤孔四贞的机会,命令自己的爱徒嘉三假扮遗孤,潜入宫中暗杀顺治皇帝。嘉三进宫后得到孝庄皇太后的宠爱,被册封为合碩公主,然而宫中看似繁华,却处处危机。在经历了种种考验后,她凭借自己的智慧和太后的庇护赢得了顺治的信任。与此同时,她在照顾未来的千古圣君康熙的过程中,也逐渐对他产生了深厚的感情。就在她犹豫如何执行暗杀计划时,顺治的爱妃董小宛病逝,顺治也“驾崩”,康熙即位为皇帝。
康熙即位后,面临着重重危机。螯拜想要篡位逼宫,平西王吴三桂也在西南地区蠢蠢欲动。假冒的孔四贞帮助康熙除掉了螯拜,渡过了难关。两人也在相处中逐渐加深感情。就在他们即将举行大婚之时,持有兵权的封疆大吏孙延龄利用与孔四贞之间的指腹为婚来要挟朝廷。与此同时,康熙结识了民间才俊伍次友,他也碰巧遇见了心仪已久的孔四贞,然而她却是独臂神尼隐匿的真正的孔家遗孤......