《密战无声》的故事发生在渡江前沿的海城,当时中共情报联络站遭到了国民党特务的破坏性袭击。为了铲除叛徒,获取情报,中共派出了齐子义同志,利用各种方法潜入国民党保密局海城站。
齐子义在海城的第一天,与军统站廖站长一起会见叛徒。意外的是,那个叛徒竟是他昔日的战友褚兴,两人都被对方认出了来。齐子义不得已使用了备用手枪,击毙了褚兴、廖站长和行动队队长刁队长,自己也被击伤。新任军统站站长尤放到病房探望齐子义时,对他产生了怀疑。
接下来,齐子义经历了数次与特务组织的斗智斗勇,并与地下市委配合,展开了一系列生死对决。他利用敌人之间尔虞我诈的局面,制造了一连串的暗杀和内部冲突。这让齐子义有机会不断获取有价值的情报,为我军的渡江战役做出了重大的贡献。